Naast de specialismes van elke groep is er veel interdisciplinair onderzoek tussen de groepen gerealiseerd binnen drie thematische programma's:

1. Regenerative Medicine
   Het thema Regenerative Medicine (regeneratieve geneeskunde) omvat weefselkweek, stamcel therapie, medische apparatuur en andere technieken om beschadigd of ziek weefsel en organen te repareren.
   
   
2. Molecular Imaging
   In het thema Molecular Imaging (moleculaire beeldvorming) zijn de disciplines moleculaire biolgie en in vivo imaging verenigd om specifieke biomarkers te ontwerpen, fabriceren en gebruiken voor:
   
   • visualisatie van celfuntionaliteit en moleculaire processen in levende organismen zonder deze te verstoren,
   • zowel vroege detectie en behandeling van ziektes als farmaceutische ontwikkelingen.
   Biomarkers spelen een belangrijke rol in de diagnose van kanker en van neurologische en cardiovasculaire ziektes. Bovendien, wordt er gewerkt aan het verbeteren van de resolutie en gevoeligheid van beeldvormingstechnieken.
   
   
3. Systems Biology
   Het thema Systems Biology (systeembiologie) heeft als doel om een verschuiving te bewerkstelligen van het 'beschrijven' van levensprocessen naar het 'begrijpen' ervan en deze processen vast te leggen in getoetste voorspellende modellen. Uiteindelijk willen we deze processen ook 'kunnen 'beïnvloeden' en 'onder controle krijgen'. Binnen dit thema vallen alle niveaus; van moleculen tot organen en mensen zoals beschreven door het transcriptoom, het proteoom, het metaboloom en het fysioom.